SNAI1

SNAI1
Structures disponibles
PDB	Recherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB
	2Y48, 3W5K, 4QLI
Identifiants
Aliases	SNAI1
IDs externes	OMIM: 604238 MGI: 98330 HomoloGene: 4363 GeneCards: SNAI1
Position du gène (Homme)
Chr.	Chromosome 20 humain
Fin	49,988,886 bp
Position du gène (Souris)
Chr.	Chromosome 2 (souris)
Fin	167,384,734 bp
Expression génétique
	Fortement exprimé dans
	vésicule biliaire; ; left uterine tube; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; aorte ascendante; ; upper lobe of left lung; ; poumon droit; ; artère coronaire gauche; ; artère coronaire droite; ; right adrenal gland;
	Fortement exprimé dans
	Crête neurale; ; mésoderme; ; calvaria; ; placenta; ; Sclérotome; ; morula; ; maxillary prominence; ; allantoïde; ; tracheobronchial tree; ; derme;
	Plus de données d'expression de référence
	Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire	sequence-specific DNA binding; liaison ADN; RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; liaison ion métal; liaison de kinase; liaison protéique; DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; Fixation d'acide nucléique; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; E-box binding;
Composant cellulaire	noyau; cytoplasme; nucléoplasme; pericentric heterochromatin; cytosol;
Processus biologique	trophoblast giant cell differentiation; roof of mouth development; regulation of bicellular tight junction assembly; positive regulation of cell migration; regulation of transcription by RNA polymerase II; epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation; negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; développent d'un organisme multicellulaire; negative regulation of vitamin D biosynthetic process; régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN; negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; osteoblast differentiation; negative regulation of cell differentiation involved in embryonic placenta development; cartilage morphogenesis; hair follicle morphogenesis; left/right pattern formation; mesoderm development; negative regulation of transcription, DNA-templated; migration cellulaire; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; Notch signaling involved in heart development; mesoderm formation; Transition épithélio-mésenchymateuse; positive regulation of epithelial to mesenchymal transition; heterochromatin organization; aortic valve morphogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
	6615
	20613
	ENSG00000124216
	ENSMUSG00000042821
	O95863
	Q02085
	NM_005985
	NM_011427
	NP_005976
	NP_035557
	Wikidata
Voir/Editer Humain	Voir/Editer Souris

Le SNAI1 (appelé aussi snail ou snail1) est un facteur de transcription à doigt de zinc. Son gène est le SNAI1 situé sur le chromosome 20 humain.

Rôles[modifier | modifier le code]

Il réprime l'expression des claudines et des occludines intervenant dans les jonctions serrées au niveau de la transition épithélium-mésenchyme^[5], ce qui constitue une autre voie d'action que celle de la cadhérine E ^[6].

En médecine[modifier | modifier le code]

Plusieurs germes permettent l'activation de cette protéine entraînant une perméabilité de la barrière hémato-encéphalique^[7].

Notes et références[modifier | modifier le code]

↑ ^{a b et c} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000124216 - Ensembl, May 2017
↑ ^{a b et c} GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000042821 - Ensembl, May 2017
↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ Ikenouchi J, Matsuda M, Furuse M, Tsukita S, Regulation of tight junctions during the epithelium-mesenchyme transition: direct repression of the gene expression of claudins/occludin by Snail, J Cell Sci, 2003;116:1959–1967
↑ Ohkubo T, Ozawa M, The transcription factor Snail downregulates the tight junction components independently of E-cadherin downregulation, J Cell Sci, 2004;117:1675–1685
↑ Kim BJ, Hancock BM, Bermudez A et al. Bacterial induction of Snail1 contributes to blood-brain barrier disruption, J Clin Invest, 2015;125:2473-2483

[refGRCh38Ensembl-1] {a b et c} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000124216 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] {a b et c} GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000042821 - Ensembl, May 2017

[3] « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine

[4] « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine

[Ikenouchi_2003-5] Ikenouchi J, Matsuda M, Furuse M, Tsukita S, Regulation of tight junctions during the epithelium-mesenchyme transition: direct repression of the gene expression of claudins/occludin by Snail, J Cell Sci, 2003;116:1959–1967

[Ohkubo_2004-6] Ohkubo T, Ozawa M, The transcription factor Snail downregulates the tight junction components independently of E-cadherin downregulation, J Cell Sci, 2004;117:1675–1685

[Kim_2015-7] Kim BJ, Hancock BM, Bermudez A et al. Bacterial induction of Snail1 contributes to blood-brain barrier disruption, J Clin Invest, 2015;125:2473-2483

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