Site AP

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Un site AP est un emplacement de l'ADN où la base (normalement attachée) est manquante. En l'absence de réparation, ils peuvent mener à une rupture simple brin. Lors de la réplication, ils mènent très souvent à une mutation.

Un site AP (site apurinique/apyrimidique), ou site abasique, est un emplacement de l'ADN où la base (purine ou pyrimidine) est manquante. En termes de séquence génétique, c'est donc un site "vacant".

Origines[modifier | modifier le code]

Les sites AP apparaissent spontanément par dépurination ou plus rarement par dépyrimidination (hydrolyse), au rythme d'environ 10000 par jour et par cellule. Dans chaque cellule, on en trouve en permanence entre 50 000 et 200 000, ce taux variant d'un tissu à l'autre[1],[2].

Ils constituent également le premier stade de la réparation par excision de base (REB) de l'ADN. Dans ce processus, une enzyme spécialisées (une glycosylase) identifie une base abimée et clive le lien N-glycosidique pour libérer la base: le site abasique ainsi créé peut (et doit) ensuite être réparé par d'autres enzymes pour reconstituer la séquence génétique initiale[3].

Réparation[modifier | modifier le code]

Normalement, les sites AP isolés sont réparés via l'action successives des enzymes du système REB (principalement endonucléase AP, ADN polymérase β, puis ADN ligase)[4].

Les sites AP peuvent également apparaître suite à une irradiation. Dans ce cas on observe souvent des "grappes", c'est-à-dire plusieurs sites AP localisés côte-à-côte. Ces grappes sont très difficiles à réparer, et peuvent persister pendant plusieurs jours[5].

Effets délétères[modifier | modifier le code]

En l'absence de réparation, les sites AP évoluent en quelques jours vers une rupture simple brin de l'ADN (effet clastogène)[6].

Les sites AP ont par ailleurs un très fort effet mutagène : au moment de la réplication, les ADN polymérase n'ont aucun moyen de savoir quelle base placer en face de ces sites vacants, et vont "choisir" une base arbitrairement. Le plus souvent, les polymérases vont insérer préférentiellement une adénine (la "règle du A"), de sorte que le site abasique sera remplacé par une thymine[7],[8].

Enfin, les semble qu'un site AP puisse dans certaines conditions engendrer une réticulation inter-brin (en anglais, (en) DNA interstrand cross-link), ce qui pourrait mener à la mort de la cellule (effet cytotoxique)[9].

Voir aussi[modifier | modifier le code]

Articles connexes[modifier | modifier le code]

Bibliographie[modifier | modifier le code]

Notes et références[modifier | modifier le code]

Liens externes[modifier | modifier le code]