OpenBabel

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OpenBabel
Description de l'image Open Babel computer icon.png.

Informations
Développé par l'équipe de développement d'OpenBabel
Dernière version 3.1.1 ()[1]Voir et modifier les données sur Wikidata
Dépôt github.com/openbabel/openbabelVoir et modifier les données sur Wikidata
Écrit en C++Voir et modifier les données sur Wikidata
Système d'exploitation Microsoft WindowsVoir et modifier les données sur Wikidata
Environnement Multiplate-forme
Formats lus Chemical Markup Language, International Chemical Identifier, MDL Molfile (d), Protein Data Bank (en), FASTA, Alchemy Format (d), Gaussian Cube File (d), CDX Format (en), Crystallographic Information File, Format .xyz, Free Form Fractional format (d) et MCDL format (d)Voir et modifier les données sur Wikidata
Formats écrits Simplified Molecular Input Line Entry Specification, Chemical Markup Language, International Chemical Identifier, InChIKey (d), MDL Molfile (d), Multilevel Neighborhoods of Atoms format (d), Free Form Fractional format (d), MCDL format (d) et CAChe MolStruct (d)Voir et modifier les données sur Wikidata
Langues Multilingue
Type Bibliothèque logicielle
Logiciel de chimie (d)Voir et modifier les données sur Wikidata
Licence Licence publique générale GNU version 2 ou ultérieure (d)Voir et modifier les données sur Wikidata
Site web openbabel.sourceforge.net

Le logiciel libre OpenBabel est un système expert principalement utilisé dans des applications de chemo-informatique pour la conversion de fichiers de structures chimiques. Ce logiciel est disponible pour Windows, Unix, et Mac OS. Il est distribué sous licence GNU GPL.

L'objectif du projet scientifique Open Babel est d'offrir aux utilisateurs et aux développeurs un ensemble de programmes et de bibliothèques logicielles multiplate-forme conçu pour la modélisation moléculaire, la chimie et de nombreux domaines connexes, tel que la conversion de format de fichiers et de données.

Historique[modifier | modifier le code]

OpenBabel et JOELib sont dérivés de la bibliothèque logicielle OELib. OELib était basé sur des concepts issus du programme Babel et de la bibliothèque logicielle Obabel.

Principales fonctionnalités[modifier | modifier le code]

  • Système expert de chimie
  • Interconvertion de nombreux formats de fichiers de données chimiques.
  • Recherche de sous-structures (basée sur les descripteurs SMARTS)
  • Calcul d'empreintes binaires
  • Adaptateur Python
  • Adaptateur Perl

Notes et références[modifier | modifier le code]

  1. « Release 3.1.1 », (consulté le 9 mai 2020)

Annexes[modifier | modifier le code]

Bibliographie[modifier | modifier le code]

  • The Blue Obelisk-Interoperability in Chemical Informatics, Rajarshi Guha, Michael T. Howard, Geoffrey R. Hutchison, Peter Murray-Rust, Henry Rzepa, Christoph Steinbeck, Jörg K. Wegner, and Egon L. Willighagen, J. Chem. Inf. Model.; 2006; DOI:10.1021/ci050400b

Articles connexes[modifier | modifier le code]

  • Ghemical, un programme de mécanique moléculaire basé sur OpenBabel
  • JOELib, version Java d'OpenBabel/OELib
  • XDrawChem, programme de dessin moléculaire 2D basé sur OpenBabel

Liens externes[modifier | modifier le code]