Mycota (classification phylogénétique)

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Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Mycota (Fungi, Champignons), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations de parenté existant entre leurs différents groupes (ou taxa), telles que les dernières analyses reconnues les proposent. Ce n'est qu'une possibilité, et les principaux débats qui subsistent au sein de la communauté scientifique sont brièvement présentés ci-dessous, avant la bibliographie.


Arbre phylogénétique[modifier | modifier le code]

Le cladogramme présenté ici se veut cohérent avec les dernières analyses publiées et accessibles. Il n'est pas forcément consensuel, et on peut toujours se référer à la bibliographie indiquée au bas de l'article.

Le symbole renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré. Tout nœud de l'arbre portant plus de deux branches montre une indétermination de la phylogénie interne du groupe considéré.

Les habitudes typographiques des botanistes et des zoologistes sont différentes. Ici, par commodité de lecture, et certains groupes actuels relevant des deux domaines traditionnels, les noms de taxons supérieurs au genre sont tous écrits en caractères droits, les noms de genres ou d'espèces en italiques.

À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien ; (Edi) : Édiacarien. Pour plus de précision si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.



└─o Fungi ou Mycota
  ├─o
  │ ├─o Neocallimastigomycetes
  │ └─? Chytridiomycota s.s.
  │   ├─o Monoblepharidomycetes
  │   └─o Chytridiomycetes
  └─o
    ├─o Blastocladiomycota ou Blastocladiomycetes
    └─o Zygomycota (paraphylétique)
      ├─?
      │ ├─o Microsporidia 
      │ └─o Rozella
      ├─o
      │ ├─o
      │ │ ├─o Olpidium
      │ │ └─o Basidiobolales
      │ ├─o Entomophthoromycotina
      │ └─o
      │   ├─o Zoopagomycotina
      │   └─o Kickxellomycotina
      └─o
        ├─o Mucormycotina ou Mucoromycotina
        └─o Symbiomycota
          ├─o Dikarya
          │ ├─o Basidiomycota 
          │ └─o Ascomycota 
          └─o Glomeromycota


Débat scientifique relatif à la phylogénie des Mycota[modifier | modifier le code]

Au sein des Opisthocontes monophylétiques, la monophylie des Champignons est également avérée, à condition d'en éliminer plusieurs groupes protistes autrefois considérés comme des « Champignons inférieurs » (et dont le nom scientifique se termine toujours avec le suffixe « -myc- »), et classés aujourd'hui parmi les Straménopiles, donc très loin de notre clade, ou les Mésomycétozoaires, c'est-à-dire plus près des Animaux que des Champignons.

Aujourd'hui, les analyses s'accordent sur la paraphylie des Chytridiomycètes et peut-être des Zygomycètes, mais divergent sur la place exacte des Microsporidies qui sont peut-être des Zygomycètes plutôt que le groupe frère des Champignons. La proximité des Gloméromycètes (autrefois classés parmi les Zygomycètes) et des « Champignons supérieurs » ne semble plus devoir être remise en question, non plus que la monophylie de ceux-ci et des deux groupes qui les constituent (Ascomycètes et Basidiomycètes).

Les Chytridiomycètes s.l. s'avèrent être le grade primitif des Champignons. En leur sein, les Blastocladiales s.l. sont peut-être plus proches parents des Zygomycètes que des Chytridiomycètes proprement dits. Parmi ces derniers, les Spizellomycètes eux-mêmes se sont avérés polyphylétiques, et les Olpidiacés en ont été retirés, Rozella étant peut-être plus proche des Microsporidies, Olpidium des Basidiobolales, etc.


Classification selon Cavalier-Smith 1998[modifier | modifier le code]

Cette classification n'est pas à proprement parler phylogénétique. Basée sur les nouvelles phylogénies, elle maintient néanmoins des taxons paraphylétiques, notamment à la base des lignées évolutives, par commodité. Elle maintient également les niveaux traditionnels de classification (règnes, phyla, classes, etc.). Ses « Entéromycètes » sont aujourd'hui considérés comme des Mésomycétozoaires, plus proches des animaux que des champignons.

Classification proposée par Adl et al. 2005[modifier | modifier le code]

Ce comité a proposé une nouvelle classification, remplaçant celle des anciens Protistes et tenant compte des phylogénies moléculaires récentes. Elle regroupe les Eucaryotes en six groupes réputés monophylétiques. Voici ce qui concerne les Champignons.

En savoir plus[modifier | modifier le code]

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Sources bibliographiques de référence[modifier | modifier le code]

Sources internet[modifier | modifier le code]

Articles connexes[modifier | modifier le code]