Modèle:Réaction biochimique simple

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 Documentation[modifier] [purger]

Utilisation[modifier le code]

Ce modèle permet l'écriture d'une réaction biochimique utilisant des images de molécules en insérant les images et les données dans un tableau formaté.

Dans le modèle, l'affichage du sens de la réaction se fait à l'aide d'une image dont le nom est formaté d'après les éléments du modèle, d'où l'intérêt de bien suivre les explications du modèle. Dans les exemples ci-dessous, les variables du nom de l'image sont mises en italique :

  • Biochem reaction arrow reversible YYNN horiz med.svg
  • Biochem reaction arrow reversible NNNN horiz med.svg
  • Biochem reaction arrow forward NNNN horiz med.svg

Syntaxe[modifier le code]

Modèle à copier à l'emplacement désiré.
{{Réaction biochimique simple
 |nombre substrat         = 
 |substrat                = 
 |image substrat          = 
 |nombre produit          = 
 |produit                 = 
 |image produit           = 
 |direction réaction      = réversible <!-- (suivant/réversible/inverse) -->
 |enzyme suivant          = 
 |enzyme inverse          = 
 |substrat mineur suivant = 
 |produit mineur suivant  = 
 |substrat mineur inverse = 
 |produit mineur inverse  = 
}}

Paramètres[modifier le code]

Icône pour souligner l'importance du texte
Le sens de la réaction est affiché sous la forme d'une image dont le nom est formatée d'après les éléments suivant par :
  • direction réaction (suivant/réversible/inverse)
  • substrat mineur suivant
  • produit mineur suivant
  • substrat mineur inverse
  • produit mineur inverse

Il est donc important de respecter le nom du sens de la réaction en minuscule. Si les substrats et produits mineurs, suivant ou inverses sont renseignés, cela ajoute des caractères au nom de l'image automatiquement.

Voir les modèles pour visualisation.
Titre du tableau
Paramètre Explication
Nombre substrat Nombre de substrat si supérieur à 1
substrat Nom du subrat
image substrat Nom de l'image du substrat (Obligatoire)
Nombre produit Nombre de produit si supérieur à 1
produit Nom du produit de la réaction
image produit Nom de l'image du produit (Obligatoire)
direction réaction Peut recevoir suivant pour une réaction dans le sens gauche droite, inverse pour l'autre sens et réversible pour une réaction réversible.

Par défaut : réversible

enzyme suivant Nom de l'enzyme suivant
enzyme inverse Nom de l'enzyme inverse
substrat mineur suivant Nom du substrat mineur suivant
produit mineur suivant Nom du produit mineur suivant
substrat mineur inverse Nom du substrat mineur inverse
produit mineur inverse Nom du produit mineur inverse

Exemple[modifier le code]

{{Réaction biochimique simple
 |nombre substrat         = 
 |substrat                = [[1-lysophosphatidylcholine]]
 |image substrat          = 2-Acylglycerin-3-phosphocholin.svg
 |nombre produit          = 
 |produit                 = [[2-lysophosphatidylcholine]]
 |image produit           = 1-Acylglycerin-3-phosphocholin.svg
 |direction réaction      = réversible <!-- (suivant/réversible/inverse) -->
 |enzyme suivant          = 
 |enzyme inverse          = 
 |substrat mineur suivant = 
 |produit mineur suivant  = 
 |substrat mineur inverse = 
 |produit mineur inverse  = 
}}
1-lysophosphatidylcholine 2-lysophosphatidylcholine
2-Acylglycerin-3-phosphocholin.svg 1-Acylglycerin-3-phosphocholin.svg
Biochem reaction arrow reversible NNNN horiz med.svg
{{Réaction biochimique simple
 |nombre substrat         = 
 |substrat                = [[Glucose]]
 |image substrat          = D-glucose wpmp.svg
 |nombre produit          = 
 |produit                 = [[Glucose-6-phosphate|Glc-6-P]]
 |image produit           = Alpha-D-glucose-6-phosphate wpmp.svg
 |direction réaction      = réversible <!-- (suivant/réversible/inverse) -->
 |enzyme suivant          = ''[[Hexokinase]]'' – <small>'''{{N° EC|2|7|1|1}}'''</small>
 |enzyme inverse          = ''[[Hexokinase]]'' – <small>'''{{N° EC|2|7|1|1}}'''</small>
 |substrat mineur suivant = [[Adénosine triphosphate|ATP]]
 |produit mineur suivant  = H{{exp|+}} + [[Adénosine diphosphate|ADP]]
 |substrat mineur inverse = &nbsp;
 |produit mineur inverse  = &nbsp;
}}
Glucose HexokinaseEC 2.7.1.1 Glc-6-P
D-glucose wpmp.svg Alpha-D-glucose-6-phosphate wpmp.png
ATP H+ + ADP
Biochem reaction arrow reversible YYYY horiz med.svg
   
HexokinaseEC 2.7.1.1
{{Réaction biochimique simple
 |nombre substrat         = 
 |substrat                = <small>D</small>-[[glucose]]
 |image substrat          = D-glucose wpmp.svg
 |nombre produit          = 2
 |produit                 = [[Acide pyruvique|Pyruvate]]
 |image produit           = Pyruvate2 wpmp.svg
 |direction réaction      = suivant <!-- (suivant/réversible/inverse) -->
 |enzyme suivant          = 
 |enzyme inverse          = 
 |substrat mineur suivant = 2 [[Adénosine diphosphate|ADP]] + 2 [[Phosphate inorganique|P{{ind|i}}]] + 2 [[Nicotinamide adénine dinucléotide|NAD{{exp|+}}]]
 |produit mineur suivant  = 2 [[Adénosine triphosphate|ATP]] + 2 [[Nicotinamide adénine dinucléotide|(NADH+H{{exp|+}})]]  + 2 [[Eau|{{fchim|H|2|O}}]]
 |substrat mineur inverse = 
 |produit mineur inverse  = 
}}
D-glucose Pyruvate
D-glucose wpmp.svg Pyruvate2 wpmp.png
2 ADP + 2 Pi + 2 NAD+ 2 ATP + 2 (NADH+H+) + 2 H2O
Biochem reaction arrow forward YYNN horiz med.svg