Modèle:Infobox Protéine

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Ce modèle permet la mise en place d'une infoboîte modulaire sur les pages consacrées à une protéine ou à une enzyme particulière. Il est à utiliser conjointement avec {{Infobox Protéine/Caractéristiques espèces}}, ces deux modèles devant être encadrés par {{Infobox/Début}} et {{Infobox/Fin}}.

Syntaxe[modifier le code]

Les champs à compléter pour cette infoboîte sont les suivants :

{{Infobox/Début}}
{{Infobox Protéine
 | nom                 = 
 | nom approuvé        = 
 | image               = 
 | image-taille        = 
 | légende             = 
 | alternative         = 
 | symbole             = 
 | synonymes           = 
 | fonction            = 
 | distribution        = 
 | localisation        = 
 | N°_EC               = 
 | DrugBank            = 
 | ATC_liste           = {{ATC|}}
 | PDB_liste           = {{PDB2|}}
}}
{{Infobox Protéine/Caractéristiques espèces
 | nom espèce          = 
  [...]
}}
{{Infobox/Fin}}

Paramètres[modifier le code]

Cette infoboîte permet d'indiquer les données générales d'une protéine. Les données relatives à une sous-unité ou à un peptide exprimé à partir d'un gène précis chez une espèce données sont à indiquer à l'aide de l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces ».

Paramètres du modèle

ParamètreDescriptionTypeStatut
Nomnom

Nom de la protéine

Chaînefacultatif
Nom approuvénom approuvé

Nom retenu dans les bases de données, idéalement issu d'UniProt

Chaînefacultatif
Imageimage

Illustration de la protéine ou d'un de ses domaines

Chaînefacultatif
Taille de l'imageimage-taille

Permet d'ajuster la taille de l'image en spécifiant le nombre de pixels. 280 correspond à la largeur maximum dans l'infoboîte.

Chaînefacultatif
Légende de l'imagelégende

Description de l'illustration, idéalement avec sa source.

Chaînefacultatif
Symbolesymbole

Symbole HUGO pour les protéines humaines, nom du gène principal dans le cas général

Chaînefacultatif
Synonymessynonymes

Noms et symboles alternatifs de la protéine. Ils peuvent être très nombreux, aussi convient-il de se limiter aux plus courants afin d'éviter de surcharger l'infoboîte d'informations peu pertinentes.

Chaînefacultatif
N° ECN°_EC

Numéros EC de chacune des activités enzymatiques de la protéine, séparés par le signe « + ».

Exemple
6.3.5.5+2.1.3.2+3.5.2.3
Chaînefacultatif
DrugBankDrugBank

Identifiant de la protéine dans la base de données DrugBank.

Exemple
DB00030
Chaînefacultatif
Liste des codes ATCATC_liste

Liste des codes ATC, entrés à l'aide du modèle {{ATC|}}.

Exemple
{{ATC|A10AB01}}
Chaînefacultatif
Liste de structures PDBPDB_liste

Liste de structures PDB, entrées à l'aide du modèle {{PDB2|}}. Ces structures peuvent être très nombreuses (plusieurs dizaines, voire centaines), auquel cas il est préférable de les indiquer dans l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces » en mode compact (avec boîte déroulante).

Chaînefacultatif
Fonctionfonction

Fonctions biochimiques et physiologiques de la protéine

Chaînefacultatif
Distributiondistribution

Distribution de la protéine entre les différents tissus.

Chaînefacultatif
Localisationlocalisation

Localisation de la protéine entre les différents compartiments cellulaires au sein des cellules.

Chaînefacultatif
Chromosomechromosome

(paramètre obsolète) Chromosome humain portant le gène codant la la protéine. Cette information est mieux indiquée dans l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces », qui permet de détailler chaque gène pour une espèce donnée.

Chaînefacultatif
Brasbras

(paramètre obsolète) Bras p ou q du chromosome humain portant le gène codant la protéine. Cette information est mieux indiquée dans l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces », qui permet de détailler chaque gène pour une espèce donnée.

Chaînefacultatif
Bandebande

(paramètre obsolète) Bande chromosomique portant le gène codant la protéine. Cette information est mieux indiquée dans l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces », qui permet de détailler chaque gène pour une espèce donnée.

Chaînefacultatif

Exemple[modifier le code]

Protéine trifonctionnelle CAD
à renseigner
Domaine dihydroorotase de la protéine CAD humaine (PDB 4C6C)
Caractéristiques générales
Nom approuvé Carbamyl-phosphate synthase II / Aspartate carbamoyltransférase / Dihydroorotase
Symbole CAD
N° EC 6.3.5.5+2.1.3.2+3.5.2.3
Homo sapiens
Locus 2p23.3
Masse moléculaire 242 984 Da[1]
Nombre de résidus 2 225 acides aminés[1]
Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO.
{{Infobox/Début}}
{{Infobox Protéine
 | nom                 = Protéine trifonctionnelle CAD
 | nom approuvé        = Carbamyl-phosphate synthase II / Aspartate carbamoyltransférase / Dihydroorotase
 | image               = 4c6c.png
 | image-taille        = 270
 | légende             = Domaine [[dihydroorotase]] de la protéine CAD humaine ({{PDB|4C6C}})
 | alternative         = à renseigner
 | symbole             = CAD
 | synonymes           = 
 | fonction            = 
 | distribution        = 
 | N°_EC               = 6.3.5.5+2.1.3.2+3.5.2.3
 | DrugBank            = 
 | ATC_liste           = {{ATC|}}
 | PDB_liste           = {{PDB2|}}
}}
{{Infobox Protéine/Caractéristiques espèces
 | nom espèce          = Homo sapiens
 | chromosome          = 2
 | bras                = p
 | bande               = 23.3
 | fin_de_locus        = 
 | localisation        = 
 | point isoélectrique = 
 | masse_en_daltons    = 242984
 | nbre_de_residus     = 2225
 | AltSymbols          = 
 | mise_en_boite       = oui
 | DrugBank            = 
 | EntrezGene          = 790
 | HGNCid              = 1424
 | OMIM                = 114010
 | UniProt             = P27708
 | RefSeq_ARNm         = {{RefSeq|NM_001306079.1}}, {{RefSeq|NM_004341.4}}
 | RefSeq_prot         = {{RefSeq|NP_001293008.1}}, {{RefSeq|NP_004332.2}}
 | Ensembl             = ENSG00000084774
 | PDB_liste           = {{PDB2|4BY3}}, {{PDB2|4C6B}}, {{PDB2|4C6C}}, {{PDB2|4C6D}}, {{PDB2|4C6E}}, {{PDB2|4C6F}}, {{PDB2|4C6I}}, {{PDB2|4C6J}}, {{PDB2|4C6K}}, {{PDB2|4C6L}}, {{PDB2|4C6M}}, {{PDB2|4C6N}}, {{PDB2|4C6O}}, {{PDB2|4C6P}}, {{PDB2|4C6Q}}
 | symbole             = CAD
 | hugo                = 1424
}}
{{Infobox/Fin}}

Module complémentaire[modifier le code]

Voir aussi[modifier le code]

Références[modifier le code]

  1. a et b Les valeurs de la masse et du nombre de résidus indiquées ici sont celles du précurseur protéique issu de la traduction du gène, avant modifications post-traductionnelles, et peuvent différer significativement des valeurs correspondantes pour la protéine fonctionnelle.