Modèle:Infobox Protéine

	Protéine trifonctionnelle CAD
	; Domaine dihydroorotase de la protéine CAD humaine (PDB 4C6C)
Caractéristiques générales
Nom approuvé	Carbamyl-phosphate synthase II / Aspartate carbamoyltransférase / Dihydroorotase
Symbole	CAD
N° EC	6.3.5.5+2.1.3.2+3.5.2.3
Homo sapiens
Locus	2p23.3
Masse moléculaire	242 984 Da
Nombre de résidus	2 225 acides aminés
	Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO.
Entrez	790
HUGO	1424
OMIM	114010
UniProt	P27708
RefSeq (ARNm)	NM_001306079.1, NM_004341.4
RefSeq (protéine)	NP_001293008.1, NP_004332.2
Ensembl	ENSG00000084774
PDB	4BY3, 4C6B, 4C6C, 4C6D, 4C6E, 4C6F, 4C6I, 4C6J, 4C6K, 4C6L, 4C6M, 4C6N, 4C6O, 4C6P, 4C6Q
	GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega

Documentation[voir] [modifier] [historique] [purger]

Ce modèle respecte les conventions des Infobox V2.

Les infobox version 2 sont des infobox modulaires composées à partir de blocs génériques comme {{Infobox/Début}}, {{Infobox/Titre}}, {{Infobox/Ligne}} et {{Infobox/Image}}.

Ce modèle permet la mise en place d'une infoboîte modulaire sur les pages consacrées à une protéine ou à une enzyme particulière. Il est à utiliser conjointement avec {{Infobox Protéine/Caractéristiques espèces}}, ces deux modèles devant être encadrés par {{Infobox/Début}} et {{Infobox/Fin}}.

Syntaxe

Les champs à compléter pour cette infoboîte sont les suivants :

{{Infobox/Début}}
{{Infobox Protéine
 | nom                 = 
 | nom approuvé        = 
 | image               = 
 | image-taille        = 
 | légende             = 
 | alternative         = 
 | symbole             = 
 | synonymes           = 
 | fonction            = 
 | distribution        = 
 | localisation        = 
 | N°_EC               = 
 | DrugBank            = 
 | ATC_liste           = {{ATC|}}
 | PDB_liste           = {{PDB2|}}
}}
{{Infobox Protéine/Caractéristiques espèces
 | nom espèce          = 
  [...]
}}
{{Infobox/Fin}}

Paramètres

Cette infoboîte permet d'indiquer les données générales d'une protéine. Les données relatives à une sous-unité ou à un peptide exprimé à partir d'un gène précis chez une espèce données sont à indiquer à l'aide de l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces ».

Paramètres du modèle[Modifier les données du modèle]
Paramètre		Description	Type	État
Nom	`nom`	Nom de la protéine	Chaîne	facultatif
Nom approuvé	`nom approuvé`	Nom retenu dans les bases de données, idéalement issu d'UniProt	Chaîne	facultatif
Image	`image`	Illustration de la protéine ou d'un de ses domaines	Chaîne	facultatif
Taille de l'image	`image-taille`	Permet d'ajuster la taille de l'image en spécifiant le nombre de pixels. 280 correspond à la largeur maximum dans l'infoboîte.	Chaîne	facultatif
Légende de l'image	`légende`	Description de l'illustration, idéalement avec sa source.	Chaîne	facultatif
Symbole	`symbole`	Symbole HUGO pour les protéines humaines, nom du gène principal dans le cas général	Chaîne	facultatif
Synonymes	`synonymes`	Noms et symboles alternatifs de la protéine. Ils peuvent être très nombreux, aussi convient-il de se limiter aux plus courants afin d'éviter de surcharger l'infoboîte d'informations peu pertinentes.	Chaîne	facultatif
N° EC	`N°_EC`	Numéros EC de chacune des activités enzymatiques de la protéine, séparés par le signe « + ». Exemple 6.3.5.5+2.1.3.2+3.5.2.3	Chaîne	facultatif
DrugBank	`DrugBank`	Identifiant de la protéine dans la base de données DrugBank. Exemple DB00030	Chaîne	facultatif
Liste des codes ATC	`ATC_liste`	Liste des codes ATC, entrés à l'aide du modèle {{ATC\|}}. Exemple {{ATC\|A10AB01}}	Chaîne	facultatif
Liste de structures PDB	`PDB_liste`	Liste de structures PDB, entrées à l'aide du modèle {{PDB2\|}}. Ces structures peuvent être très nombreuses (plusieurs dizaines, voire centaines), auquel cas il est préférable de les indiquer dans l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces » en mode compact (avec boîte déroulante).	Chaîne	facultatif
Fonction	`fonction`	Fonctions biochimiques et physiologiques de la protéine	Chaîne	facultatif
Distribution	`distribution`	Distribution de la protéine entre les différents tissus.	Chaîne	facultatif
Localisation	`localisation`	Localisation de la protéine entre les différents compartiments cellulaires au sein des cellules.	Chaîne	facultatif
Chromosome	`chromosome`	(paramètre obsolète) Chromosome humain portant le gène codant la la protéine. Cette information est mieux indiquée dans l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces », qui permet de détailler chaque gène pour une espèce donnée.	Chaîne	facultatif
Bras	`bras`	(paramètre obsolète) Bras p ou q du chromosome humain portant le gène codant la protéine. Cette information est mieux indiquée dans l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces », qui permet de détailler chaque gène pour une espèce donnée.	Chaîne	facultatif
Bande	`bande`	(paramètre obsolète) Bande chromosomique portant le gène codant la protéine. Cette information est mieux indiquée dans l'infoboîte « Infobox Protéine/Caractéristiques espèces », qui permet de détailler chaque gène pour une espèce donnée.	Chaîne	facultatif

Exemple

{{Infobox/Début}}
{{Infobox Protéine
 | nom                 = Protéine trifonctionnelle CAD
 | nom approuvé        = Carbamyl-phosphate synthase II / Aspartate carbamoyltransférase / Dihydroorotase
 | image               = 4c6c.png
 | image-taille        = 270
 | légende             = Domaine [[dihydroorotase]] de la protéine CAD humaine ({{PDB|4C6C}})
 | alternative         = à renseigner
 | symbole             = CAD
 | synonymes           = 
 | fonction            = 
 | distribution        = 
 | N°_EC               = 6.3.5.5+2.1.3.2+3.5.2.3
 | DrugBank            = 
 | ATC_liste           = {{ATC|}}
 | PDB_liste           = {{PDB2|}}
}}
{{Infobox Protéine/Caractéristiques espèces
 | nom espèce          = Homo sapiens
 | chromosome          = 2
 | bras                = p
 | bande               = 23.3
 | fin_de_locus        = 
 | localisation        = 
 | point isoélectrique = 
 | masse_en_daltons    = 242984
 | nbre_de_residus     = 2225
 | AltSymbols          = 
 | mise_en_boite       = oui
 | DrugBank            = 
 | EntrezGene          = 790
 | HGNCid              = 1424
 | OMIM                = 114010
 | UniProt             = P27708
 | RefSeq_ARNm         = {{RefSeq|NM_001306079.1}}, {{RefSeq|NM_004341.4}}
 | RefSeq_prot         = {{RefSeq|NP_001293008.1}}, {{RefSeq|NP_004332.2}}
 | Ensembl             = ENSG00000084774
 | PDB_liste           = {{PDB2|4BY3}}, {{PDB2|4C6B}}, {{PDB2|4C6C}}, {{PDB2|4C6D}}, {{PDB2|4C6E}}, {{PDB2|4C6F}}, {{PDB2|4C6I}}, {{PDB2|4C6J}}, {{PDB2|4C6K}}, {{PDB2|4C6L}}, {{PDB2|4C6M}}, {{PDB2|4C6N}}, {{PDB2|4C6O}}, {{PDB2|4C6P}}, {{PDB2|4C6Q}}
 | symbole             = CAD
 | hugo                = 1424
}}
{{Infobox/Fin}}

Module complémentaire

{{Infobox Protéine/Caractéristiques espèces}}

Voir aussi

Tutoriel infobox modulaire

Références

↑ ^{a et b} Les valeurs de la masse et du nombre de résidus indiquées ici sont celles du précurseur protéique issu de la traduction du gène, avant modifications post-traductionnelles, et peuvent différer significativement des valeurs correspondantes pour la protéine fonctionnelle.

Projet Infobox

La documentation de ce modèle est générée par le modèle {{Documentation}}.
Elle est incluse depuis sa sous-page de documentation. Veuillez placer les catégories sur cette page-là.
Les éditeurs peuvent travailler dans le bac à sable (créer) et la page de test (créer).
Voir les statistiques d'utilisation du modèle sur l'outil wstat.

[Masse_et_nombre_de_résidus-1] {a et b} Les valeurs de la masse et du nombre de résidus indiquées ici sont celles du précurseur protéique issu de la traduction du gène, avant modifications post-traductionnelles, et peuvent différer significativement des valeurs correspondantes pour la protéine fonctionnelle.

[1]