Excavata

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Excavata

Giardia intestinalis

Classification
Sous-domaine	Bikonta

Règne

Excavata
(Cavalier-Smith) Simpson, 2003

Embranchements de rang inférieur

Position phylogénétique

Eukaryota
- Unikonta
  - Amoebozoa
  - Opisthokonta
    - Holomycota
      - Nucleariida
      - Fungi
    - Holozoa
      - Mesomycetozoa
      - Filozoa
        Filasterea
        
        Choanobionta
        Choanomonada
        
        Metazoa
- Bikonta
  - Apusozoa
  - Excavata
  - Plantae
  - Chromalveolata s.l.
    - Hacrobia
      - Cryptophyta
      - Haptophyta
    - Harosa

Les Excavata (Excavés, ce qui signifie creusés) ou Excavobionta sont un règne d'eucaryotes unicellulaires hétérotrophes et généralement flagellés. Le type ancestral se caractérise par la présence d'une zone creusée, le cytostome, permettant l'ingestion de fines particules alimentaires. De nombreux excavates sont anaérobies ou microaérophile et contiennent des organites particuliers et spécialisés : les mitosomes et les hydrogénosomes, EX : Diplomonade

De nombreux Excavobiontes sont des parasites de l'homme ou d'autres animaux. Ex : Trypanosomes, Giardia

Certains possèdent des plastes (endosymbionte secondaire) et sont photosynthétiques : Euglénoides

Les excavés étaient inclus autrefois dans le règne aujourd'hui obsolète des Protista^[1].

Ils sont classifiés selon leurs structures flagellaires,^[2] et ils sont considérés comme la lignèe la plus basale des flagellés^[3].

Les excavés du sous-règne des Discoba (Euglenozoa, Percolozoa, Tsukubea, Jakobea) semblent être des eucaryotes de type basal, tandis que les Metamonada et le genre Malawimonas semblent maintenant être des clades frères des Podiata. Les Discoba pourraient être hautement paraphylétiques^[4].

Les Euglenobionta et les Metamonada forment deux groupes monophylétiques.

Classification

Sous-règne 1
- Classe des Malawimonadidea
- Embranchement des Metamonada
  - Super-classe des Anaeromonada ou Preaxostyla
  - Super-classe des Trichozoa
    - Classe des Fornicata
    - Classe des Parabasalia
    - Classe des Malawimonas
    - Classe des Preaxostyla
    - Classe des Jakobida
    - Classe des Heterolobosea
    - Classe des Euglenozoa
Sous-règne des Discoba
- Embranchement des Jakobea
- Super-embranchement des Discicristata
  - Embranchement des Euglenozoa ou Euglenobionta
  - Embranchement des Percolozoa

Notes et références

↑ (en) T Cavalier-Smith, « The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 52, n^o 2,‎ 2002, p. 297–354 (PMID 11931142, DOI 10.1099/00207713-52-2-297, lire en ligne)
↑ (en) AG Simpson, « Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota) », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 53, n^o Pt 6,‎ 2003, p. 1759–1777 (PMID 14657103, DOI 10.1099/ijs.0.02578-0)
↑ (en) Scott C Dawson et Alexander R Paredez, « Alternative cytoskeletal landscapes: cytoskeletal novelty and evolution in basal excavate protists », Current Opinion in Cell Biology, vol. 25, n^o 1,‎ 2013, p. 134–141 (PMID 23312067, PMCID 4927265, DOI 10.1016/j.ceb.2012.11.005)
↑ (en) Thomas Cavalier-Smith, Ema E. Chao et Rhodri Lewis, « 187-gene phylogeny of protozoan phylum Amoebozoa reveals a new class (Cutosea) of deep-branching, ultrastructurally unique, enveloped marine Lobosa and clarifies amoeba evolution », Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 99,‎ 1^er juin 2016, p. 275–296 (PMID 27001604, DOI 10.1016/j.ympev.2016.03.023, lire en ligne)

Liens externes

Sur les autres projets Wikimedia :

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Excavata, sur Wikispecies

(en) Référence Paleobiology Database : Excavata (consulté le 11 janvier 2018)
Modèle:UBIO
(en) Référence WoRMS : Excavata Cavalier-Smith (+ liste embranchements + liste classes) (consulté le 11 janvier 2018)
Tree of Life: Eukaryotes
Vladimir Hampl et al., 2009, Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic “supergroups”

Portail de la microbiologie

[pmid11931142-1] (en) T Cavalier-Smith, « The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 52, n^o 2,‎ 2002, p. 297–354 (PMID 11931142, DOI 10.1099/00207713-52-2-297, lire en ligne)

[2] (en) AG Simpson, « Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota) », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 53, n^o Pt 6,‎ 2003, p. 1759–1777 (PMID 14657103, DOI 10.1099/ijs.0.02578-0)

[3] (en) Scott C Dawson et Alexander R Paredez, « Alternative cytoskeletal landscapes: cytoskeletal novelty and evolution in basal excavate protists », Current Opinion in Cell Biology, vol. 25, n^o 1,‎ 2013, p. 134–141 (PMID 23312067, PMCID 4927265, DOI 10.1016/j.ceb.2012.11.005)

[Cavalier-Smith_275–296-4] (en) Thomas Cavalier-Smith, Ema E. Chao et Rhodri Lewis, « 187-gene phylogeny of protozoan phylum Amoebozoa reveals a new class (Cutosea) of deep-branching, ultrastructurally unique, enveloped marine Lobosa and clarifies amoeba evolution », Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 99,‎ 1^er juin 2016, p. 275–296 (PMID 27001604, DOI 10.1016/j.ympev.2016.03.023, lire en ligne)

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