Discussion:Variants du SARS-CoV-2

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Fusion entre Variants du SARS-CoV-2 et Liste des souches et mutations du SARS-CoV-2[modifier le code]

Discussion transférée depuis Wikipédia:Pages à fusionner
Bonjour, je pense que ces deux articles créés à 1 jour d'intervalle traitent du même sujet mais les contributeurs de chaque ne se sont pas encore rencontrés. Ced78180 (discuter) 12 février 2021 à 20:57 (CET)

Avis très favorable à la fusion d'articles proposée (et aux harmonisations qui en résulteront). mm Mazzella2 (discuter) 14 février 2021 à 07:07 (CET)
Avis favorable. A priori je cherche "Variant" comme nom d'article (principe de moindre surprise), mais peut-être que liste de souche est le nom correct, je n'en sais rien. Pour information je crois qu'il n'y pas d'article liste de souche de la grippe, mais elles sont bien détaillées dans l'article Vaccin contre la grippe saisonnière alors qu'elles ne sont pas détaillées dans l'article Vaccin contre la Covid-19. Il est vrai que ce dernier est volumineux et la logique voudrait qu'à l'heure actuelle tous les vaccins soient issus de la même souche.--JackAttack (discuter) 15 février 2021 à 10:21 (CET)
  • Pour, les 2 articles traitent du même sujet. --Thepat (discuter) 16 février 2021 à 12:47 (CET)

Fait. Nouill 18 février 2021 à 01:17 (CET)

clarification du sujet[modifier le code]

Bonjour, Dans l'article tel qu'il est actuellement, le quidam moyen non initié dont je suis à un peu de mal à s'y retrouver entre souches, variants, séquences, mutations, termes pour l'instant pas tous reliés à leurs article général. On ne comprends pas bien actuellement si les variants "héritent" les uns des autres, si il y a une sorte de hiérarchie familiale? comment les mutations sont reliées au variant. Je constate que l'article en anglais contient un tableau pour tenter d'expliquer la nomenclature mais les "variants" ne semblent pas porter le même nom que dans l'article en français. Il serait donc souhaitable que des spécialistes mettent un peu de cohérence dans tout ça. Ced78180 (discuter) 25 février 2021 à 19:14 (CET)

@Ced78180 Il faut mettre des phylogénies sinon on comprend rien. 2A01:E0A:852:9590:9178:F5AC:E9DC:A7B7 (discuter) 4 mai 2021 à 11:07 (CEST)

Mutation au codon 248 de la protéine S[modifier le code]

Le NTD est le fragment le plus instable de la protéine S, autrement dit celui qui mute le plus rapidement. Il est anticipé que la prochaine mutation majeure sur le NTD se produise sur le codon 248. Cette mutation pourrait encore affaiblir davantage les anticorps des vaccins de première génération (AstraZeneca, Pfizer, Moderna…)[1],[2].

D'après nextstrain.org, le 1er variant qui mute sur le codon 248 est le lineage C37 classé pour l'instant dans le clade 20D. Il comporte les mutations suivantes :

  • Protéine S: L5F, G75V, T76I, R246-, S247-, Y248-, L249-, T250-, P251-, G252-, D253N, L452Q, F490S, D614G, T859N
  • Protéine N: P13L, R203K, G204R, G214C
  • Protéine ORF9b: P10S
  • ORF1a: T1246I, T1876I, I2235L, P2287S, F2387V, L3201P, T3255I, G3278S, S3675-, G3676-, F3677-
  • ORF1b: P314L

Ce variant a été détecté pour la 1e fois en décembre 2020. Son génome peut être consulté à l'adresse suivante : accession MW938095.1. Il est présent au Chili et se répand en Amérique latine. Il a été détecté en Allemagne et en Espagne (https://cov-lineages.org/lineages/lineage_C.37.html). Ce variant a le potentiel pour faire des gros dégâts. --Polaert (discuter) 15 mai 2021 à 15:33 (CEST)

Cela mérite d'être présenté dans l'article. --A1AA1A (discuter) 15 mai 2021 à 17:23 (CEST)
Dans la presse, ce variant a été baptisé variant andin. Je le découvre aujourd'hui. Polaert (discuter) 15 mai 2021 à 19:44 (CEST)

Renommer les articles avec les nouveaux noms de l'OMS[modifier le code]

Bonjour à tous, je propose d'utiliser les noms vernaculaires officiels choisis par l'OMS et de renommer les articles en conséquence :

Chaque variant a plusieurs noms scientifiques et plusieurs surnoms. Ces nouveaux noms ont été créés pour mettre de la clarté dans tout ça. Qu'en pensez-vous ? Sourire --François C. (discuter) 10 juin 2021 à 21:18 (CEST)

Pour Je suis on ne peut plus d'accord avec l'idée d'harmoniser les titres des variants, cela serait vraiment une bonne chose selon moi. Le principe de moindre surprise est par ailleurs rompu avec ces titres composés de chiffres et de lettres que personne ne retient. J'avais proposé il y a quelques temps une harmonisation des articles concernant les vaccins mais je n'ai jamais eu de réponse... cela me semble pourtant être du bon sens. Rbrugeat93 (discuter) 10 juin 2021 à 21:49 (CEST)
Exemple :
  • TozinaméranVaccin Pfizer–BioNTech contre la Covid-19
  • VLA2001Vaccin de Valneva contre la Covid-19

Je vais faire les renommages (WP:NHP) des variants car de toutes façons les titres actuels sont un peu incohérents en utilisant aux moins deux nomenclatures différentes. Concernant les vaccins, Notification Rbrugeat93 : pourquoi pas mais je pense que c'est plutôt une discussion à avoir sur la page Vaccin contre la Covid-19 Sourire. --François C. (discuter) 11 juin 2021 à 11:34 (CEST)

Concernant les deux options Variant Alpha et Variant alpha, je suis allé faire le tour de la presse et des sites officiels et la majuscule est utilisée en majorité. On retrouve la minuscule au Figaro, chez Libé ou la RTBF mais ce n'est pas l'usage majoritaire. --François C. (discuter) 11 juin 2021 à 11:38 (CEST)
  1. Céline Deluzarche, « Coronavirus : l'efficacité des anticorps est réduite à zéro en moins de 80 jours », Futura Santé,‎ (lire en ligne, consulté le 25 mars 2021).
  2. (en) Emanuele Andreano, « SARS-CoV-2 escape in vitro from a highly neutralizing COVID-19 convalescent plasma », biorxiv,‎ (lire en ligne, consulté le 25 mars 2021).