La coupe d'Afrique de rugby2006 est une compétition organisée par la Confédération africaine de rugby qui oppose les 12 meilleures nations africaines. Cette compétition remplace le Top 9 de 2005, le Cameroun, le Sénégal et la Zambie sont les nouveaux venus. Les résultats des poules A et B sont pris en compte pour les qualifications à la Coupe du monde de rugby 2007 en France.
Les poules A et B se jouent en matchs aller/retour, les vainqueurs jouent une demi-finale en aller/retour également. Les poules C et D se jouent en match unique.