Le cinquième niveau du championnat oppose cent-douze clubs français répartis en huit groupes de quatorze clubs, en une série de vingt-six rencontres jouées durant la saison de football.
Les premières places de chaque groupe permettent de monter en CFA lors de la saison suivante alors que les quatre dernières places de chaque groupe sont synonyme de relégation en division d'honneur.
Ces tableaux présentent les cent-douze équipes qualifiées pour disputer le championnat 2012-2013. On y trouve le nom des clubs, leur ancienneté en CFA 2, leur classement de la saison précédente, le nom des stades ainsi que la capacité de ces derniers.
Le championnat comprend huit groupes de quatorze équipes.
L'USC Cortenais est repêché en CFA 2 en tant que sixième meilleur douzième[10] à la suite de l'exclusion des championnats nationaux du Besançon RC par la DNCG[11].
L'US Lormont est repêché en CFA 2 en tant que huitième meilleur douzième[10] à la suite de la décision de l'AJ Auxerre de retirer sa 2e réserve du CFA 2 et au repêchage refusé au septième meilleur douzième, l'AS Fresnoy-le-Grand, par la DNCG[12].
Le Noisy-le-Sec OB93 est repêché en CFA 2 en tant que cinquième meilleur douzième[10] à la suite de l'exclusion des championnats nationaux de Pacy VEF par la DNCG[13].
R Relégué de CFA. P Promu de Division d'Honneur. Pts points ; G victoires ; N match nuls ; P défaites Bp buts marqués ; Bc buts encaissés ; Diff différence de buts
R Relégué de CFA. P Promu de Division d'Honneur. Pts points ; G victoires ; N match nuls ; P défaites Bp buts marqués ; Bc buts encaissés ; Diff différence de buts
R Relégué de CFA. P Promu de Division d'Honneur. Pts points ; G victoires ; N match nuls ; P défaites Bp buts marqués ; Bc buts encaissés ; Diff différence de buts
R Relégué de CFA. P Promu de Division d'Honneur. Pts points ; G victoires ; N match nuls ; P défaites Bp buts marqués ; Bc buts encaissés ; Diff différence de buts
R Relégué de CFA. P Promu de Division d'Honneur. Pts points ; G victoires ; N match nuls ; P défaites Bp buts marqués ; Bc buts encaissés ; Diff différence de buts
R Relégué de CFA. P Promu de Division d'Honneur. Pts points ; G victoires ; N match nuls ; P défaites Bp buts marqués ; Bc buts encaissés ; Diff différence de buts
R Relégué de CFA. P Promu de Division d'Honneur. Pts points ; G victoires ; N match nuls ; P défaites Bp buts marqués ; Bc buts encaissés ; Diff différence de buts
R Relégué de CFA. P Promu de Division d'Honneur. Pts points ; G victoires ; N match nuls ; P défaites Bp buts marqués ; Bc buts encaissés ; Diff différence de buts
↑À l'intersaison, l'US Ailly-sur-Somme fusionne avec l'Entente Sportive Saint Vast - Vaux - Vignacourt - Bertangles, club de Promotion Interdistrict Picardie, pour former le FC Ailly sur Somme Samara.
↑Après un rapprochement effectué dès 2010 au niveau de leurs équipes de jeunes, le Saint-Alban Omnisports FC et l'US Aucamville (2e Division de District Midi Toulousain) fusionnent à l'intersaison pour former le Saint-Alban Aucamville FC.
↑La réserve du CS Sedan Ardennes est rétrogradé à la suite de la rétrogradation de l'équipe première en CFA 2.
↑L'US Gravelinoise est finalement sauvé à la suite des nombreuses rétrogradations administratives.
↑L'AS Belfort Sud est finalement sauvé à la suite des nombreuses rétrogradations administratives.
↑Le SO Châtelleraudais est finalement sauvé à la suite des nombreuses rétrogradations administratives.