Bioclipse

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Bioclipse
Développeur Le projet Bioclipse
Dernière version 2.0.1 ()Voir et modifier les données sur Wikidata
Version avancée 2.1.0 v20090807 ()Voir et modifier les données sur Wikidata
Écrit en JavaVoir et modifier les données sur Wikidata
Environnement Multiplate-forme
Type Chemo-informatique/Bio-informatique
Licence Eclipse Public License
Site web www.bioclipse.net

Bioclipse est un logiciel de visualisation utilisé en chimie et en bio-informatique. Il est développé en langage de programmation Java sur la plateforme client riche Eclipse et est distribué sous licence open source.

Bioclipse utilise une architecture à base de plugins qui hérite des fonctionnalités de base et des interfaces graphiques d'Eclipse, tels que le système d'aide, l'interface de mise à jour du logiciel, la gestion des préférences, le déploiement multiplate-forme, etc. Grâce à ces plugins, Bioclipse fournit de nombreuses fonctions pour la chémo- et la bio-informatique, et propose des possibilités d'extension qui permettent d'ajouter facilement de nouvelles fonctionnalités.

La première version stable de Bioclipse inclut un plugin CDK (back-end de chemo-informatique), un plugin Jmol pour la visualisation 3D et un plugin BioJava pour l'analyse de séquences. Bioclipse est développé par un consortium de laboratoires :

Ces développements ont été enrichies par de nombreuses contributions d'autres laboratoires académiques.

Voir aussi[modifier | modifier le code]

Liens externes[modifier | modifier le code]

Références[modifier | modifier le code]

  • Ola Spjuth, Tobias Helmus, Egon L Willighagen, Stefan Kuhn, Martin Eklund, Johannes Wagener, Peter Murray-Rust, Christoph Steinbeck, Jarl E.S. Wikberg
    Bioclipse: An open source workbench for chemo- and bioinformatics,
    BMC Bioinformatics, 2007, 8. DOI:10.1186/1471-2105-8-59