« Quaranjavirus » : différence entre les versions

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Quaranjavirus est un genre de virus à ARN monocaténaire de polarité négative de la famille des Orthomyxoviridae, laquelle comprend également les différents virus de la grippe. Ce sont des virus à génome segmenté, le plus souvent à 6 segments. Le nom du gene fait référence au virus Quaranfil, du nom d'un quartier cairote d'où il a été isolé, et à l'Atoll Johnston (Johnston Atoll, donnant les lettres « ja » du nom « Quaranjavirus »). Le virus du lac Tchad est également pressenti pour rejoindre ce genre de virus[2].

Les quaranjavirus infectent essentiellement les arthropodes et les oiseaux. Ces virus sont transmis aux vertébrés par des tiques, à l'instar des thogotovirus. Le virus Quaranfil est, en 2015, le seul du genre dont on a montré qu'il est également susceptible d'infecter des humains.

Génétique et structure

Il s'agit de virus enveloppés pléomorphes, généralement sphériques ou ovoïdes mais pouvant adopter des formes variées, dont les particules ont un diamètre compris entre 80 et 120 nm[3]. Les virions contiennent une dizaine de granules évoquant des ribosomes et qui les font ressembler à des arénavirus[3].

Ces virus contiennent généralement six segments d'ARN monocaténaire de sens négatif ayant chacun une longueur de 0,9 à 2,4 kilobases et au total une longueur de 11,5 kilobases. Le virus de la baie de Wellfleet contient un septième segment de 519 nucléotides[4]. Chacun de ces segments exprime une protéine. L'ARN polymérase ARN-dépendante est codée par les trois segments les plus longs, notés PA, PB1 et PB2, comme pour les autres orthomyxovirus. Le segment 5 code une glycoprotéine d'enveloppe, tandis que les segments 4 et 6 codent des protéines dont la fonction est inconnue[5], bien qu'on ait proposé de les associer aux nucléoprotéines et aux protéines de matrice respectivement[4]. La glycoprotéine des quaranjavirus n'est pas du tout apparentée aux glycoprotéines des virus de la grippe (hémagglutinine, neuraminidase, glycoprotéine HEF), mais présente au contraire des analogies avec la glycoprotéine gp64 des Baculoviridae, qui infecte les insectes, et des thogotovirus, transmis par les tiques.

Le cycle de réplication du virus Quaranfil dure environ 24 à 36 heures, ce qui est comparable à celui des thogotovirus et plus long que celui des virus de la grippe[2].

Notes et références

  1. (en) « Virus Taxonomy: 2018b Release », ICTV, (consulté le ).
  2. a et b (en) Rachel M. Presti, Guoyan Zhao, Wandy L. Beatty, Kathie A. Mihindukulasuriya, Amelia P. A. Travassos da Rosa, Vsevolod L. Popov, Robert B. Tesh, Herbert W. Virgin et David Wang, « Quaranfil, Johnston Atoll, and Lake Chad Viruses Are Novel Members of the Family Orthomyxoviridae », Journal of Virology, vol. 83, no 22,‎ , p. 11599-11606 (PMID 19726499, PMCID 2772707, DOI 10.1128/JVI.00677-09, lire en ligne)
  3. a et b (en) H. G. Zeller, N. Karabatsos, Ch. H. Calisher, J. -P. Digoutte, F. A. Murphy et R. E. Shope, « Electron microscopy and antigenic studies of uncharacterized viruses. I. Evidence suggesting the placement of viruses in families Arenaviridae, Paramyxoviridae, or Poxviridae », Archives of Virology, vol. 108, nos 3-4,‎ , p. 191-209 (PMID 2690775, DOI 10.1007/bf01310934, lire en ligne)
  4. a et b (en) Andrew B. Allison, Jennifer R. Ballard, Robert B. Tesh, Justin D. Brown, Mark G. Ruder, M. Kevin Keel, Brandon A. Munk, Randall M. Mickley, Samantha E. J. Gibbs, Amelia P. A. Travassos da Rosa, Julie C. Ellis, Hon S. Ip, Valerie I. Shearn-Bochsler, Matthew B. Rogers, Elodie Ghedin, Edward C. Holmes, Colin R. Parrish et Chris Dwyer, « Cyclic Avian Mass Mortality in the Northeastern United States Is Associated with a Novel Orthomyxovirus », Journal of Virology, vol. 89, no 2,‎ , p. 1389-1403 (PMID 25392223, PMCID 4300652, DOI 10.1128/JVI.02019-14, lire en ligne)
  5. (en) « Quaranjavirus », sur ExPASy, Institut suisse de bioinformatique (consulté le ).