Boîte TATA
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La boîte TATA (TATA box ou Goldberg-Hogness box en anglais)[1] est une séquence d'ADN (un élément cis-régulateur) présente au niveau de la séquence promotrice d'une partie des gènes des eucaryotes [2],[3],[4],[5] . Cette séquence d'ADN codée TATA se situe à environ 25 nucléotides en amont du premier nucléotide transcrit (N+1). Cette séquence sert en partie de lieu de reconnaissance à l'ARN polymérase chez les eucaryotes.
Chez les procaryotes, il existe aussi un autre ensemble de séquence jouant un rôle similaire. Il est composé d'une séquence situé à 35 nucléotides en amont du premier transcrit: on l'appelle "-35 box". Et d'une séquence située en -10 appelée "-10 box" ou boîte de Pribnow. La boîte TATAAT (-10) commence donc 10 nucléotides avant le premier transcrit.
Localisation de la boîte de Pribnow et de la « -35 box » sur un promoteur procaryote :
<-- amont aval -->
5'-XXXXXXXPPPPPXXXXXXPPPPPPXXXXGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGXXXX-3'
-35 -10 +1 gène d'intérêt
TTGACA TATAAT
Localisation de la boîte TATA chez les eucaryotes :
5'-XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXPPPPXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG-3'
-30 gène d'intérêt
TATA box
[modifier] Notes et références
- Lifton RP, Goldberg ML, Karp RW, Hogness DS. (1978). The organization of the histone genes in Drosophila melanogaster: functional and evolutionary implications. Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 42, 1047-1051. PMID 98262
- Smale ST, Kadonaga JT (2003). The RNA polymerase II core promoter. Annu Rev Biochem. 72, 449-479. PMID 12651739 PDF
- C Yang, « Prevalence of the initiator over the TATA box in human and yeast genes and identification of DNA motifs enriched in human TATA-less core promoters. », dans Gene, vol. 389, no 1, 2007, p. 52–65 [lien PMID, lien DOI]
- Carninci P, Sandelin A, Lenhard B, et al., « Genome-wide analysis of mammalian promoter architecture and evolution », dans Nat. Genet., vol. 38, no 6, juin 2006, p. 626–35 [lien PMID, lien DOI]
- Suzuki Y, Tsunoda T, Sese J, et al., « Identification and characterization of the potential promoter regions of 1031 kinds of human genes », dans Genome Res., vol. 11, no 5, mai 2001, p. 677–84 [lien PMID, lien DOI]
