Candidatus Pelagibacter ubique

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Pelagibacter ubique

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Pelagibacter ubique

Classification
Règne Bacteria
Embranchement Proteobacteria
Classe Alpha Proteobacteria
Ordre Rickettsiales
— non-classé — groupe SAR11

Genre

Candidatus Pelagibacter
Rappé et al., 2002

Nom binominal

Candidatus Pelagibacter ubique
Rappé et al., 2002

Candidatus Pelagibacter ubique est une petite alphaproteobacteria hétérotrophe, trouvée dans tous les océans. C'est peut-être la bactérie la plus représentée au monde (peut-être 1028 cellules). Cette bactérie était à l'origine nommée SAR11 et connue seulement grâce à ses ARNr identifiés dans des échantillons de la mer des Sargasses en 1990. La bactérie a ensuite été isolée et décrite en 2002.

Composant du bactérioplancton, Candidatus Pelagibacter a une distribution mondiale. Très petite, elle a une longueur de 0,37-0,89 µm et un diamètre de seulement 0,12-0,20 µm.

Tout petit, le génome de Candidatus Pelagibacter est séquencé : il contient 1,3 Mpb et 1 354 gènes. Il n’y a pas d’introns, pas de transposons, pas de pseudogènes, pas d’éléments extragéniques, pas d’intéines et peu de paralogues.

Références[modifier | modifier le code]

  • Michael S. Rappé, Stephanie A. Connon, Kevin L. Vergin, Stephen J. Giovannoni (2002). "Cultivation of the ubiquitous SAR11 marine bacterioplankton clade". Nature 418: 630-633.
  • R. M. Morris et al. (2002). "SAR11 clade dominates ocean surface bacterioplankton communities". Nature 420: 806 - 810.
  • Stephen J. Giovannoni, H. James Tripp et. al (2005). "Genome Streamlining in a Cosmopolitan Oceanic Bacterium". Science 309: 1242-1245.


Liens externes[modifier | modifier le code]